Большинство крупных городов и посёлков городского типа - неблагополучные с точки зрения экологии территории. Например, Чита, расположенная в котловине, является очагом сильного загрязнения природной среды. Особенности климата - длительный период холодов, сильные морозы, недостаточный по толщине снежный покров - уменьшают способность природы к самоочищению. В Чите выявлено загрязнение иинком, ртутью, хромом.
Город Балей возник в 1938 г. и долгое время был одним из крупнейших золотодобывающих центров. Здесь обнаружены участки грунта с повышенной концентрацией радона; отмечено значительное загрязнение воздуха пылью с горных выработок. В городе Краснокаменск, основанном в 60-х гг. XX в. в связи с освоением крупного месторождения урана, повышено содержание радона в жилых помещениях и питьевой воде, зафиксированы и другие случаи радиоактивного загрязнения природной среды.